Amoksisilin aşağıda tanımlanan duyarlı suşların neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde endikedir. -Gram negatif organizmalar-H. influenzae,E.coli, P. mirabilis ve N. gonorrhoeae. -Gram pozitif organizmalar-Streptococci- (Streptococcus faecalis dahil)-D.pneumoniae ve penisilinaz- üretmeyen staphylococci. Tedavi, enfeksiyona neden olan organizmaları ve amoksisilin’ e olan duyarlılıklarını belirlemek için yapılan bakteriyolojik duyarlılık çalışmalarından elde edilen sonuçlardan önce başlatılabilir. Endike cerrahi prosedürler de uygulanmış olmalıdır.